Protein–RNA interactions for Protein: Q16602

CALCRL, Calcitonin gene-related peptide type 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCRLQ16602 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CALCRLQ16602 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CALCRLQ16602 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CALCRLQ16602 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CALCRLQ16602 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CALCRLQ16602 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CALCRLQ16602 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CALCRLQ16602 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CALCRLQ16602 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CALCRLQ16602 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CALCRLQ16602 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CALCRLQ16602 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CALCRLQ16602 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CALCRLQ16602 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CALCRLQ16602 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CALCRLQ16602 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CALCRLQ16602 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CALCRLQ16602 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CALCRLQ16602 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CALCRLQ16602 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CALCRLQ16602 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CALCRLQ16602 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CALCRLQ16602 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CALCRLQ16602 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CALCRLQ16602 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CALCRLQ16602 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CALCRLQ16602 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CALCRLQ16602 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CALCRLQ16602 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CALCRLQ16602 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CALCRLQ16602 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CALCRLQ16602 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CALCRLQ16602 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CALCRLQ16602 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CALCRLQ16602 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CALCRLQ16602 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CALCRLQ16602 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CALCRLQ16602 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CALCRLQ16602 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CALCRLQ16602 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CALCRLQ16602 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CALCRLQ16602 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CALCRLQ16602 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CALCRLQ16602 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CALCRLQ16602 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CALCRLQ16602 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CALCRLQ16602 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CALCRLQ16602 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CALCRLQ16602 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CALCRLQ16602 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CALCRLQ16602 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CALCRLQ16602 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CALCRLQ16602 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CALCRLQ16602 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CALCRLQ16602 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CALCRLQ16602 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CALCRLQ16602 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CALCRLQ16602 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CALCRLQ16602 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CALCRLQ16602 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CALCRLQ16602 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CALCRLQ16602 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CALCRLQ16602 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CALCRLQ16602 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CALCRLQ16602 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CALCRLQ16602 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CALCRLQ16602 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CALCRLQ16602 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CALCRLQ16602 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CALCRLQ16602 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CALCRLQ16602 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CALCRLQ16602 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CALCRLQ16602 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CALCRLQ16602 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CALCRLQ16602 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CALCRLQ16602 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CALCRLQ16602 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CALCRLQ16602 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CALCRLQ16602 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CALCRLQ16602 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CALCRLQ16602 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CALCRLQ16602 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CALCRLQ16602 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CALCRLQ16602 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CALCRLQ16602 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CALCRLQ16602 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CALCRLQ16602 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CALCRLQ16602 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CALCRLQ16602 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CALCRLQ16602 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CALCRLQ16602 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CALCRLQ16602 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CALCRLQ16602 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CALCRLQ16602 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CALCRLQ16602 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CALCRLQ16602 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CALCRLQ16602 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CALCRLQ16602 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CALCRLQ16602 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CALCRLQ16602 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms