Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC18A3Q16572 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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