Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NTRK3Q16288 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
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