Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NPTX1Q15818 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms