Protein–RNA interactions for Protein: Q15459

SF3A1, Splicing factor 3A subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A1Q15459 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SF3A1Q15459 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SF3A1Q15459 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SF3A1Q15459 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SF3A1Q15459 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SF3A1Q15459 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SF3A1Q15459 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SF3A1Q15459 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SF3A1Q15459 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SF3A1Q15459 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SF3A1Q15459 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SF3A1Q15459 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SF3A1Q15459 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SF3A1Q15459 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SF3A1Q15459 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SF3A1Q15459 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SF3A1Q15459 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SF3A1Q15459 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SF3A1Q15459 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SF3A1Q15459 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SF3A1Q15459 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SF3A1Q15459 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SF3A1Q15459 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SF3A1Q15459 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SF3A1Q15459 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SF3A1Q15459 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SF3A1Q15459 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SF3A1Q15459 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SF3A1Q15459 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SF3A1Q15459 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SF3A1Q15459 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SF3A1Q15459 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SF3A1Q15459 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SF3A1Q15459 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SF3A1Q15459 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SF3A1Q15459 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SF3A1Q15459 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SF3A1Q15459 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SF3A1Q15459 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SF3A1Q15459 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SF3A1Q15459 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SF3A1Q15459 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SF3A1Q15459 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SF3A1Q15459 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SF3A1Q15459 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SF3A1Q15459 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SF3A1Q15459 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SF3A1Q15459 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SF3A1Q15459 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SF3A1Q15459 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SF3A1Q15459 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SF3A1Q15459 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SF3A1Q15459 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SF3A1Q15459 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SF3A1Q15459 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SF3A1Q15459 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SF3A1Q15459 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SF3A1Q15459 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SF3A1Q15459 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SF3A1Q15459 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SF3A1Q15459 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SF3A1Q15459 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SF3A1Q15459 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SF3A1Q15459 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SF3A1Q15459 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SF3A1Q15459 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SF3A1Q15459 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SF3A1Q15459 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SF3A1Q15459 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SF3A1Q15459 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SF3A1Q15459 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SF3A1Q15459 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SF3A1Q15459 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SF3A1Q15459 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SF3A1Q15459 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SF3A1Q15459 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SF3A1Q15459 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SF3A1Q15459 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SF3A1Q15459 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SF3A1Q15459 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SF3A1Q15459 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SF3A1Q15459 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SF3A1Q15459 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SF3A1Q15459 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SF3A1Q15459 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SF3A1Q15459 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SF3A1Q15459 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SF3A1Q15459 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SF3A1Q15459 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SF3A1Q15459 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SF3A1Q15459 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SF3A1Q15459 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SF3A1Q15459 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SF3A1Q15459 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SF3A1Q15459 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SF3A1Q15459 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SF3A1Q15459 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SF3A1Q15459 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SF3A1Q15459 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SF3A1Q15459 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
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