Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
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SEC23BQ15437 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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SEC23BQ15437 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEC23BQ15437 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
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