Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PUM3Q15397 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
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