Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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