Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CSHL1Q14406 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms