Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CNGB1Q14028 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CNGB1Q14028 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CNGB1Q14028 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CNGB1Q14028 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CNGB1Q14028 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CNGB1Q14028 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CNGB1Q14028 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CNGB1Q14028 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CNGB1Q14028 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CNGB1Q14028 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CNGB1Q14028 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CNGB1Q14028 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CNGB1Q14028 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CNGB1Q14028 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CNGB1Q14028 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CNGB1Q14028 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CNGB1Q14028 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CNGB1Q14028 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CNGB1Q14028 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CNGB1Q14028 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CNGB1Q14028 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CNGB1Q14028 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CNGB1Q14028 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CNGB1Q14028 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CNGB1Q14028 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CNGB1Q14028 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CNGB1Q14028 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CNGB1Q14028 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CNGB1Q14028 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CNGB1Q14028 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CNGB1Q14028 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CNGB1Q14028 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CNGB1Q14028 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CNGB1Q14028 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CNGB1Q14028 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CNGB1Q14028 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CNGB1Q14028 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CNGB1Q14028 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CNGB1Q14028 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CNGB1Q14028 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CNGB1Q14028 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CNGB1Q14028 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CNGB1Q14028 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CNGB1Q14028 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CNGB1Q14028 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CNGB1Q14028 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CNGB1Q14028 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CNGB1Q14028 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CNGB1Q14028 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CNGB1Q14028 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CNGB1Q14028 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CNGB1Q14028 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CNGB1Q14028 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CNGB1Q14028 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CNGB1Q14028 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CNGB1Q14028 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CNGB1Q14028 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CNGB1Q14028 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CNGB1Q14028 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CNGB1Q14028 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CNGB1Q14028 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CNGB1Q14028 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CNGB1Q14028 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CNGB1Q14028 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CNGB1Q14028 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CNGB1Q14028 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CNGB1Q14028 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CNGB1Q14028 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CNGB1Q14028 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CNGB1Q14028 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CNGB1Q14028 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CNGB1Q14028 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CNGB1Q14028 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CNGB1Q14028 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CNGB1Q14028 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CNGB1Q14028 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CNGB1Q14028 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CNGB1Q14028 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CNGB1Q14028 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CNGB1Q14028 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CNGB1Q14028 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CNGB1Q14028 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CNGB1Q14028 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CNGB1Q14028 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CNGB1Q14028 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CNGB1Q14028 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CNGB1Q14028 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CNGB1Q14028 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CNGB1Q14028 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CNGB1Q14028 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CNGB1Q14028 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CNGB1Q14028 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CNGB1Q14028 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CNGB1Q14028 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CNGB1Q14028 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CNGB1Q14028 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CNGB1Q14028 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CNGB1Q14028 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CNGB1Q14028 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms