Protein–RNA interactions for Protein: Q14011

CIRBP, Cold-inducible RNA-binding protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBPQ14011 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CIRBPQ14011 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CIRBPQ14011 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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