Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CKAP5Q14008 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms