Protein–RNA interactions for Protein: Q14003

KCNC3, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC3Q14003 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNC3Q14003 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNC3Q14003 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNC3Q14003 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNC3Q14003 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNC3Q14003 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNC3Q14003 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNC3Q14003 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNC3Q14003 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNC3Q14003 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNC3Q14003 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNC3Q14003 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNC3Q14003 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNC3Q14003 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNC3Q14003 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
KCNC3Q14003 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
KCNC3Q14003 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNC3Q14003 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNC3Q14003 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNC3Q14003 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNC3Q14003 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNC3Q14003 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNC3Q14003 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNC3Q14003 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNC3Q14003 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNC3Q14003 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNC3Q14003 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNC3Q14003 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNC3Q14003 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNC3Q14003 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNC3Q14003 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNC3Q14003 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNC3Q14003 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNC3Q14003 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNC3Q14003 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNC3Q14003 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNC3Q14003 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNC3Q14003 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNC3Q14003 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNC3Q14003 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNC3Q14003 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNC3Q14003 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNC3Q14003 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNC3Q14003 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNC3Q14003 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNC3Q14003 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNC3Q14003 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNC3Q14003 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNC3Q14003 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNC3Q14003 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNC3Q14003 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNC3Q14003 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNC3Q14003 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNC3Q14003 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNC3Q14003 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNC3Q14003 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNC3Q14003 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNC3Q14003 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNC3Q14003 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNC3Q14003 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNC3Q14003 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNC3Q14003 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNC3Q14003 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNC3Q14003 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNC3Q14003 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNC3Q14003 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNC3Q14003 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNC3Q14003 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNC3Q14003 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNC3Q14003 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNC3Q14003 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNC3Q14003 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNC3Q14003 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNC3Q14003 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNC3Q14003 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNC3Q14003 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNC3Q14003 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNC3Q14003 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNC3Q14003 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNC3Q14003 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNC3Q14003 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNC3Q14003 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNC3Q14003 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNC3Q14003 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNC3Q14003 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNC3Q14003 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNC3Q14003 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNC3Q14003 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNC3Q14003 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNC3Q14003 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNC3Q14003 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNC3Q14003 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNC3Q14003 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNC3Q14003 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNC3Q14003 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNC3Q14003 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNC3Q14003 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNC3Q14003 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNC3Q14003 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNC3Q14003 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms