Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
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