Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CDH18Q13634 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CDH18Q13634 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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