Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CUL1Q13616 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
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