Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

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Length 1,198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MTMR3Q13615 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
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