Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
C1orf61Q13536 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C1orf61Q13536 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms