Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AP3B2Q13367 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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