Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
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