Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 SERF2-210ENST00000409960 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.473e-6■■■■□ 20.8
TARDBPQ13148 SUN1-214ENST00000435699 676 ntTSL 312.02□□□□□ -0.493e-6■■■■□ 20.8
TARDBPQ13148 ZFR-203ENST00000505204 552 ntTSL 412.02□□□□□ -0.493e-6■■■■□ 20.8
TARDBPQ13148 IST1-205ENST00000439924 1841 ntTSL 511.93□□□□□ -0.53e-6■■■■□ 20.8
TARDBPQ13148 COMMD10-204ENST00000507356 870 ntTSL 311.91□□□□□ -0.53e-6■■■■□ 20.8
TARDBPQ13148 METTL15-209ENST00000634627 1178 ntTSL 511.84□□□□□ -0.513e-6■■■■□ 20.8
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TARDBPQ13148 IST1-223ENST00000545518 710 ntTSL 211.72□□□□□ -0.533e-6■■■■□ 20.8
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TARDBPQ13148 IST1-219ENST00000541571 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.563e-6■■■■□ 20.8
TARDBPQ13148 IST1-211ENST00000537613 894 ntTSL 211.51□□□□□ -0.573e-6■■■■□ 20.8
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TARDBPQ13148 IST1-215ENST00000538850 1125 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.623e-6■■■■□ 20.8
TARDBPQ13148 DNMT3B-201ENST00000201963 4255 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.623e-6■■■■□ 20.8
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TARDBPQ13148 CSNK1D-226ENST00000585026 563 ntTSL 511.09□□□□□ -0.633e-6■■■■□ 20.8
TARDBPQ13148 IST1-213ENST00000538565 1245 ntTSL 211.05□□□□□ -0.643e-6■■■■□ 20.8
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TARDBPQ13148 PIK3R4-201ENST00000356763 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.663e-6■■■■□ 20.8
TARDBPQ13148 RAB3GAP2-202ENST00000358951 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.673e-6■■■■□ 20.8
TARDBPQ13148 ZNF33B-205ENST00000486187 1941 ntTSL 210.82□□□□□ -0.685e-6■■■■□ 20.8
TARDBPQ13148 CUL2-203ENST00000374749 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.683e-6■■■■□ 20.8
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TARDBPQ13148 MAST2-203ENST00000372009 4047 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.73e-6■■■■□ 20.8
TARDBPQ13148 METTL15-203ENST00000406787 4304 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.713e-6■■■■□ 20.8
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TARDBPQ13148 DSTYK-202ENST00000367162 7874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.723e-6■■■■□ 20.8
TARDBPQ13148 CCND2-201ENST00000261254 6480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.723e-6■■■■□ 20.8
TARDBPQ13148 ACSS2-217ENST00000488172 648 ntTSL 410.54□□□□□ -0.723e-6■■■■□ 20.8
TARDBPQ13148 ACSS2-224ENST00000497927 580 ntTSL 410.54□□□□□ -0.723e-6■■■■□ 20.8
TARDBPQ13148 ARHGAP12-202ENST00000344936 4128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.733e-6■■■■□ 20.8
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TARDBPQ13148 DSTYK-201ENST00000367161 7739 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.773e-6■■■■□ 20.8
TARDBPQ13148 CUL2-202ENST00000374748 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.783e-6■■■■□ 20.8
TARDBPQ13148 IST1-216ENST00000539186 542 ntTSL 410.11□□□□□ -0.793e-6■■■■□ 20.8
TARDBPQ13148 OTUD7B-202ENST00000581312 8872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.793e-6■■■■□ 20.8
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TARDBPQ13148 METTL15-208ENST00000532947 1419 ntTSL 59.63□□□□□ -0.873e-6■■■■□ 20.8
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TARDBPQ13148 CUL2-204ENST00000374751 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.893e-6■■■■□ 20.8
TARDBPQ13148 IREB2-210ENST00000560840 558 ntTSL 59.25□□□□□ -0.933e-6■■■■□ 20.8
TARDBPQ13148 TSC1-207ENST00000493467 2219 ntTSL 1 (best)9.13□□□□□ -0.953e-6■■■■□ 20.8
TARDBPQ13148 AUH-204ENST00000475023 641 ntTSL 29.09□□□□□ -0.953e-6■■■■□ 20.8
TARDBPQ13148 RBM26-204ENST00000449987 3662 ntTSL 39.04□□□□□ -0.963e-6■■■■□ 20.8
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TARDBPQ13148 PCTP-208ENST00000576221 609 ntTSL 57.67□□□□□ -1.183e-6■■■■□ 20.8
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TARDBPQ13148 TSC1-201ENST00000298552 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.233e-6■■■■□ 20.8
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TARDBPQ13148 ZNF33B-201ENST00000359467 5958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.365e-6■■■■□ 20.8
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TARDBPQ13148 RACGAP1-226ENST00000552157 386 ntTSL 36.07□□□□□ -1.443e-6■■■■□ 20.8
TARDBPQ13148 IREB2-205ENST00000559215 572 ntTSL 45.94□□□□□ -1.463e-6■■■■□ 20.8
TARDBPQ13148 CLASP2-211ENST00000476251 1097 ntTSL 55.92□□□□□ -1.463e-6■■■■□ 20.8
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TARDBPQ13148 COMMD10-206ENST00000515539 869 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.493e-6■■■■□ 20.8
TARDBPQ13148 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.515e-6■■■■□ 20.8
TARDBPQ13148 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.523e-6■■■■□ 20.8
TARDBPQ13148 IREB2-203ENST00000558570 2917 ntTSL 1 (best)5.45□□□□□ -1.543e-6■■■■□ 20.8
TARDBPQ13148 IST1-210ENST00000537571 603 ntTSL 25.42□□□□□ -1.543e-6■■■■□ 20.8
TARDBPQ13148 ITFG1-203ENST00000542691 1464 ntTSL 24.84□□□□□ -1.633e-6■■■■□ 20.8
TARDBPQ13148 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.643e-6■■■■□ 20.8
TARDBPQ13148 PIK3R4-204ENST00000508273 817 ntTSL 34.42□□□□□ -1.73e-6■■■■□ 20.8
TARDBPQ13148 AC098617.1-203ENST00000609865 277 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.723e-6■■■■□ 20.8
TARDBPQ13148 COMMD10-203ENST00000506589 793 ntTSL 53.91□□□□□ -1.783e-6■■■■□ 20.8
TARDBPQ13148 HIKESHI-204ENST00000530208 799 ntTSL 23.86□□□□□ -1.793e-6■■■■□ 20.8
TARDBPQ13148 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.833e-6■■■■□ 20.8
TARDBPQ13148 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.233e-6■■■■□ 20.8
TARDBPQ13148 LINC00534-204ENST00000524361 620 ntTSL 36.35□□□□□ -1.396e-7■■■■□ 20.8
TARDBPQ13148 CIT-202ENST00000392520 5205 ntTSL 514.67□□□□□ -0.063e-6■■■■□ 20.8
TARDBPQ13148 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.223e-6■■■■□ 20.8
TARDBPQ13148 CIT-208ENST00000537607 4958 ntTSL 511.97□□□□□ -0.493e-6■■■■□ 20.8
TARDBPQ13148 CIT-203ENST00000392521 8708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.533e-6■■■■□ 20.8
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