Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
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