Protein–RNA interactions for Protein: Q13113

PDZK1IP1, PDZK1-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1IP1Q13113 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDZK1IP1Q13113 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDZK1IP1Q13113 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDZK1IP1Q13113 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDZK1IP1Q13113 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDZK1IP1Q13113 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDZK1IP1Q13113 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDZK1IP1Q13113 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDZK1IP1Q13113 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDZK1IP1Q13113 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDZK1IP1Q13113 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDZK1IP1Q13113 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDZK1IP1Q13113 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDZK1IP1Q13113 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDZK1IP1Q13113 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDZK1IP1Q13113 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDZK1IP1Q13113 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDZK1IP1Q13113 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDZK1IP1Q13113 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PDZK1IP1Q13113 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDZK1IP1Q13113 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PDZK1IP1Q13113 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDZK1IP1Q13113 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDZK1IP1Q13113 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDZK1IP1Q13113 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDZK1IP1Q13113 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDZK1IP1Q13113 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDZK1IP1Q13113 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDZK1IP1Q13113 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDZK1IP1Q13113 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDZK1IP1Q13113 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDZK1IP1Q13113 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDZK1IP1Q13113 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDZK1IP1Q13113 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDZK1IP1Q13113 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDZK1IP1Q13113 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDZK1IP1Q13113 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDZK1IP1Q13113 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDZK1IP1Q13113 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDZK1IP1Q13113 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDZK1IP1Q13113 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDZK1IP1Q13113 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDZK1IP1Q13113 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDZK1IP1Q13113 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDZK1IP1Q13113 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDZK1IP1Q13113 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDZK1IP1Q13113 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PDZK1IP1Q13113 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDZK1IP1Q13113 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDZK1IP1Q13113 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDZK1IP1Q13113 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDZK1IP1Q13113 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDZK1IP1Q13113 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDZK1IP1Q13113 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDZK1IP1Q13113 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDZK1IP1Q13113 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDZK1IP1Q13113 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDZK1IP1Q13113 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDZK1IP1Q13113 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDZK1IP1Q13113 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDZK1IP1Q13113 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDZK1IP1Q13113 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDZK1IP1Q13113 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDZK1IP1Q13113 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDZK1IP1Q13113 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDZK1IP1Q13113 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDZK1IP1Q13113 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDZK1IP1Q13113 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDZK1IP1Q13113 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDZK1IP1Q13113 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDZK1IP1Q13113 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDZK1IP1Q13113 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDZK1IP1Q13113 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDZK1IP1Q13113 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDZK1IP1Q13113 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDZK1IP1Q13113 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDZK1IP1Q13113 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PDZK1IP1Q13113 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDZK1IP1Q13113 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PDZK1IP1Q13113 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDZK1IP1Q13113 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PDZK1IP1Q13113 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDZK1IP1Q13113 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDZK1IP1Q13113 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDZK1IP1Q13113 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDZK1IP1Q13113 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDZK1IP1Q13113 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PDZK1IP1Q13113 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PDZK1IP1Q13113 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDZK1IP1Q13113 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDZK1IP1Q13113 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDZK1IP1Q13113 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDZK1IP1Q13113 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDZK1IP1Q13113 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDZK1IP1Q13113 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDZK1IP1Q13113 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDZK1IP1Q13113 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDZK1IP1Q13113 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDZK1IP1Q13113 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDZK1IP1Q13113 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms