Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
RIPPLY1Q0D2K3 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
RIPPLY1Q0D2K3 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RIPPLY1Q0D2K3 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RIPPLY1Q0D2K3 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RIPPLY1Q0D2K3 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RIPPLY1Q0D2K3 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RIPPLY1Q0D2K3 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RIPPLY1Q0D2K3 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RIPPLY1Q0D2K3 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RIPPLY1Q0D2K3 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RIPPLY1Q0D2K3 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RIPPLY1Q0D2K3 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RIPPLY1Q0D2K3 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RIPPLY1Q0D2K3 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RIPPLY1Q0D2K3 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RIPPLY1Q0D2K3 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RIPPLY1Q0D2K3 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RIPPLY1Q0D2K3 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RIPPLY1Q0D2K3 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RIPPLY1Q0D2K3 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms