Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms