Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EGR3Q06889 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms