Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
GRIN1Q05586 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIN1Q05586 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms