Protein–RNA interactions for Protein: Q05215

EGR4, Early growth response protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR4Q05215 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EGR4Q05215 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EGR4Q05215 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EGR4Q05215 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
EGR4Q05215 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EGR4Q05215 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EGR4Q05215 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EGR4Q05215 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
EGR4Q05215 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
EGR4Q05215 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
EGR4Q05215 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EGR4Q05215 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EGR4Q05215 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms