Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBXN1Q04323 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms