Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms