Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLOD1Q02809 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms