Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNTN2Q02246 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms