Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
XPCQ01831 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
XPCQ01831 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
XPCQ01831 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
XPCQ01831 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
XPCQ01831 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
XPCQ01831 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
XPCQ01831 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
XPCQ01831 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
XPCQ01831 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
XPCQ01831 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
XPCQ01831 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
XPCQ01831 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
XPCQ01831 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
XPCQ01831 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
XPCQ01831 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
XPCQ01831 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
XPCQ01831 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
XPCQ01831 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
XPCQ01831 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
XPCQ01831 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
XPCQ01831 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
XPCQ01831 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
XPCQ01831 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
XPCQ01831 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
XPCQ01831 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
XPCQ01831 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
XPCQ01831 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
XPCQ01831 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
XPCQ01831 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
XPCQ01831 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
XPCQ01831 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
XPCQ01831 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
XPCQ01831 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
XPCQ01831 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
XPCQ01831 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
XPCQ01831 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
XPCQ01831 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
XPCQ01831 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
XPCQ01831 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
XPCQ01831 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
XPCQ01831 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
XPCQ01831 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
XPCQ01831 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
XPCQ01831 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
XPCQ01831 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
XPCQ01831 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
XPCQ01831 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
XPCQ01831 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
XPCQ01831 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
XPCQ01831 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
XPCQ01831 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
XPCQ01831 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
XPCQ01831 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
XPCQ01831 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
XPCQ01831 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
XPCQ01831 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
XPCQ01831 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
XPCQ01831 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
XPCQ01831 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
XPCQ01831 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
XPCQ01831 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
XPCQ01831 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
XPCQ01831 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
XPCQ01831 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
XPCQ01831 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
XPCQ01831 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
XPCQ01831 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
XPCQ01831 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
XPCQ01831 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
XPCQ01831 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
XPCQ01831 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
XPCQ01831 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
XPCQ01831 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
XPCQ01831 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
XPCQ01831 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
XPCQ01831 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
XPCQ01831 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
XPCQ01831 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
XPCQ01831 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
XPCQ01831 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
XPCQ01831 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
XPCQ01831 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
XPCQ01831 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
XPCQ01831 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
XPCQ01831 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
XPCQ01831 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
XPCQ01831 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
XPCQ01831 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
XPCQ01831 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
XPCQ01831 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
XPCQ01831 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
XPCQ01831 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
XPCQ01831 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
XPCQ01831 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
XPCQ01831 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
XPCQ01831 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
XPCQ01831 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
XPCQ01831 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
XPCQ01831 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms