Protein–RNA interactions for Protein: Q01814

ATP2B2, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B2Q01814 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2B2Q01814 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2B2Q01814 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2B2Q01814 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2B2Q01814 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2B2Q01814 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2B2Q01814 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2B2Q01814 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2B2Q01814 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2B2Q01814 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2B2Q01814 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2B2Q01814 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2B2Q01814 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2B2Q01814 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2B2Q01814 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2B2Q01814 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2B2Q01814 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2B2Q01814 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2B2Q01814 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2B2Q01814 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2B2Q01814 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2B2Q01814 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2B2Q01814 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2B2Q01814 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2B2Q01814 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2B2Q01814 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2B2Q01814 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2B2Q01814 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2B2Q01814 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2B2Q01814 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2B2Q01814 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2B2Q01814 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2B2Q01814 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2B2Q01814 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2B2Q01814 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2B2Q01814 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2B2Q01814 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2B2Q01814 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2B2Q01814 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2B2Q01814 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2B2Q01814 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2B2Q01814 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATP2B2Q01814 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATP2B2Q01814 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATP2B2Q01814 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATP2B2Q01814 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATP2B2Q01814 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2B2Q01814 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2B2Q01814 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2B2Q01814 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2B2Q01814 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2B2Q01814 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2B2Q01814 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2B2Q01814 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2B2Q01814 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2B2Q01814 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2B2Q01814 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2B2Q01814 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2B2Q01814 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2B2Q01814 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2B2Q01814 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2B2Q01814 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2B2Q01814 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2B2Q01814 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2B2Q01814 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2B2Q01814 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2B2Q01814 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2B2Q01814 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2B2Q01814 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2B2Q01814 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2B2Q01814 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2B2Q01814 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2B2Q01814 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2B2Q01814 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP2B2Q01814 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP2B2Q01814 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP2B2Q01814 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP2B2Q01814 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP2B2Q01814 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP2B2Q01814 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP2B2Q01814 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP2B2Q01814 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP2B2Q01814 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP2B2Q01814 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP2B2Q01814 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP2B2Q01814 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP2B2Q01814 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP2B2Q01814 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP2B2Q01814 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP2B2Q01814 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP2B2Q01814 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP2B2Q01814 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP2B2Q01814 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP2B2Q01814 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP2B2Q01814 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP2B2Q01814 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP2B2Q01814 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP2B2Q01814 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP2B2Q01814 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP2B2Q01814 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms