Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EXOSC10Q01780 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EXOSC10Q01780 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EXOSC10Q01780 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EXOSC10Q01780 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EXOSC10Q01780 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EXOSC10Q01780 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EXOSC10Q01780 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EXOSC10Q01780 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EXOSC10Q01780 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EXOSC10Q01780 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
EXOSC10Q01780 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EXOSC10Q01780 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EXOSC10Q01780 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EXOSC10Q01780 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EXOSC10Q01780 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EXOSC10Q01780 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EXOSC10Q01780 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
EXOSC10Q01780 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EXOSC10Q01780 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
EXOSC10Q01780 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EXOSC10Q01780 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EXOSC10Q01780 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EXOSC10Q01780 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EXOSC10Q01780 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EXOSC10Q01780 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EXOSC10Q01780 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EXOSC10Q01780 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EXOSC10Q01780 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EXOSC10Q01780 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EXOSC10Q01780 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EXOSC10Q01780 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EXOSC10Q01780 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
EXOSC10Q01780 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EXOSC10Q01780 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EXOSC10Q01780 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EXOSC10Q01780 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EXOSC10Q01780 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EXOSC10Q01780 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EXOSC10Q01780 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
EXOSC10Q01780 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EXOSC10Q01780 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EXOSC10Q01780 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
EXOSC10Q01780 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
EXOSC10Q01780 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EXOSC10Q01780 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
EXOSC10Q01780 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
EXOSC10Q01780 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
EXOSC10Q01780 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EXOSC10Q01780 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EXOSC10Q01780 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EXOSC10Q01780 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EXOSC10Q01780 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EXOSC10Q01780 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EXOSC10Q01780 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EXOSC10Q01780 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EXOSC10Q01780 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EXOSC10Q01780 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EXOSC10Q01780 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EXOSC10Q01780 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EXOSC10Q01780 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EXOSC10Q01780 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EXOSC10Q01780 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EXOSC10Q01780 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EXOSC10Q01780 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EXOSC10Q01780 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EXOSC10Q01780 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EXOSC10Q01780 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EXOSC10Q01780 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EXOSC10Q01780 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EXOSC10Q01780 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EXOSC10Q01780 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EXOSC10Q01780 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EXOSC10Q01780 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EXOSC10Q01780 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EXOSC10Q01780 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EXOSC10Q01780 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EXOSC10Q01780 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
EXOSC10Q01780 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EXOSC10Q01780 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EXOSC10Q01780 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
EXOSC10Q01780 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EXOSC10Q01780 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
EXOSC10Q01780 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
EXOSC10Q01780 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
EXOSC10Q01780 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EXOSC10Q01780 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EXOSC10Q01780 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EXOSC10Q01780 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EXOSC10Q01780 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EXOSC10Q01780 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EXOSC10Q01780 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EXOSC10Q01780 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
EXOSC10Q01780 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EXOSC10Q01780 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EXOSC10Q01780 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EXOSC10Q01780 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EXOSC10Q01780 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EXOSC10Q01780 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EXOSC10Q01780 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms