Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
MC1RQ01726 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
MC1RQ01726 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
MC1RQ01726 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MC1RQ01726 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms