Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms