Protein–RNA interactions for Protein: Q00604

NDP, Norrin, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDPQ00604 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NDPQ00604 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NDPQ00604 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NDPQ00604 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NDPQ00604 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NDPQ00604 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NDPQ00604 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NDPQ00604 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NDPQ00604 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NDPQ00604 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NDPQ00604 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NDPQ00604 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NDPQ00604 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NDPQ00604 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDPQ00604 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDPQ00604 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDPQ00604 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDPQ00604 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NDPQ00604 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDPQ00604 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDPQ00604 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDPQ00604 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDPQ00604 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDPQ00604 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDPQ00604 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NDPQ00604 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDPQ00604 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDPQ00604 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDPQ00604 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDPQ00604 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDPQ00604 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDPQ00604 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDPQ00604 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDPQ00604 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDPQ00604 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDPQ00604 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDPQ00604 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDPQ00604 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDPQ00604 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDPQ00604 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDPQ00604 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDPQ00604 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NDPQ00604 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDPQ00604 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDPQ00604 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDPQ00604 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDPQ00604 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDPQ00604 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDPQ00604 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDPQ00604 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDPQ00604 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDPQ00604 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDPQ00604 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDPQ00604 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NDPQ00604 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDPQ00604 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDPQ00604 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDPQ00604 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDPQ00604 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDPQ00604 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDPQ00604 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDPQ00604 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDPQ00604 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDPQ00604 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDPQ00604 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDPQ00604 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDPQ00604 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDPQ00604 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDPQ00604 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDPQ00604 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDPQ00604 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDPQ00604 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDPQ00604 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NDPQ00604 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDPQ00604 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDPQ00604 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDPQ00604 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDPQ00604 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDPQ00604 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDPQ00604 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDPQ00604 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDPQ00604 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDPQ00604 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDPQ00604 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDPQ00604 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NDPQ00604 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDPQ00604 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDPQ00604 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDPQ00604 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDPQ00604 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NDPQ00604 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDPQ00604 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NDPQ00604 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NDPQ00604 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDPQ00604 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDPQ00604 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDPQ00604 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDPQ00604 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDPQ00604 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDPQ00604 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms