Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBB4BP68371 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms