Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTBP60709 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTBP60709 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTBP60709 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTBP60709 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTBP60709 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTBP60709 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTBP60709 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTBP60709 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTBP60709 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTBP60709 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTBP60709 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTBP60709 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTBP60709 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTBP60709 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTBP60709 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTBP60709 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTBP60709 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTBP60709 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTBP60709 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTBP60709 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTBP60709 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTBP60709 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTBP60709 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACTBP60709 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACTBP60709 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACTBP60709 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACTBP60709 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACTBP60709 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACTBP60709 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACTBP60709 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACTBP60709 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACTBP60709 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACTBP60709 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACTBP60709 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTBP60709 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTBP60709 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTBP60709 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTBP60709 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTBP60709 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTBP60709 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTBP60709 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTBP60709 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTBP60709 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTBP60709 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTBP60709 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTBP60709 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTBP60709 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTBP60709 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTBP60709 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTBP60709 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTBP60709 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTBP60709 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTBP60709 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTBP60709 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTBP60709 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTBP60709 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTBP60709 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTBP60709 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTBP60709 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTBP60709 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTBP60709 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTBP60709 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTBP60709 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTBP60709 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTBP60709 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTBP60709 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTBP60709 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTBP60709 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTBP60709 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTBP60709 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTBP60709 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTBP60709 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTBP60709 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTBP60709 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTBP60709 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTBP60709 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTBP60709 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTBP60709 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTBP60709 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTBP60709 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTBP60709 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTBP60709 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTBP60709 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTBP60709 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTBP60709 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTBP60709 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTBP60709 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTBP60709 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTBP60709 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTBP60709 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTBP60709 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTBP60709 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTBP60709 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTBP60709 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTBP60709 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTBP60709 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTBP60709 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTBP60709 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTBP60709 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms