Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUP107P57740 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUP107P57740 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUP107P57740 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUP107P57740 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUP107P57740 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUP107P57740 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUP107P57740 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUP107P57740 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUP107P57740 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUP107P57740 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUP107P57740 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUP107P57740 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUP107P57740 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUP107P57740 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUP107P57740 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUP107P57740 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUP107P57740 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUP107P57740 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUP107P57740 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NUP107P57740 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUP107P57740 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUP107P57740 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUP107P57740 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUP107P57740 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUP107P57740 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NUP107P57740 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUP107P57740 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUP107P57740 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUP107P57740 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUP107P57740 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUP107P57740 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUP107P57740 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NUP107P57740 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUP107P57740 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUP107P57740 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUP107P57740 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUP107P57740 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUP107P57740 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUP107P57740 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUP107P57740 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NUP107P57740 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUP107P57740 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP107P57740 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP107P57740 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP107P57740 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP107P57740 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP107P57740 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP107P57740 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP107P57740 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP107P57740 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP107P57740 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP107P57740 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP107P57740 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP107P57740 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP107P57740 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP107P57740 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP107P57740 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP107P57740 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP107P57740 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP107P57740 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP107P57740 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP107P57740 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP107P57740 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP107P57740 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP107P57740 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP107P57740 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP107P57740 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP107P57740 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP107P57740 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP107P57740 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP107P57740 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP107P57740 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP107P57740 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP107P57740 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP107P57740 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP107P57740 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP107P57740 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP107P57740 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP107P57740 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP107P57740 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP107P57740 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUP107P57740 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUP107P57740 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUP107P57740 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUP107P57740 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUP107P57740 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUP107P57740 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUP107P57740 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUP107P57740 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUP107P57740 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUP107P57740 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUP107P57740 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUP107P57740 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUP107P57740 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUP107P57740 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUP107P57740 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NUP107P57740 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUP107P57740 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NUP107P57740 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms