Protein–RNA interactions for Protein: P56750

CLDN17, Claudin-17, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN17P56750 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN17P56750 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN17P56750 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN17P56750 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN17P56750 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN17P56750 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN17P56750 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN17P56750 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN17P56750 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN17P56750 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN17P56750 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN17P56750 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN17P56750 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN17P56750 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN17P56750 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN17P56750 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN17P56750 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN17P56750 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN17P56750 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN17P56750 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN17P56750 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN17P56750 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN17P56750 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN17P56750 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN17P56750 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN17P56750 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN17P56750 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN17P56750 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN17P56750 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN17P56750 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN17P56750 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN17P56750 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN17P56750 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN17P56750 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN17P56750 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN17P56750 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN17P56750 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN17P56750 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN17P56750 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN17P56750 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN17P56750 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN17P56750 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN17P56750 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN17P56750 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN17P56750 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN17P56750 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN17P56750 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN17P56750 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN17P56750 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN17P56750 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN17P56750 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN17P56750 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN17P56750 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN17P56750 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN17P56750 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN17P56750 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN17P56750 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN17P56750 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN17P56750 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN17P56750 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN17P56750 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN17P56750 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN17P56750 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN17P56750 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN17P56750 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN17P56750 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN17P56750 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN17P56750 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN17P56750 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN17P56750 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN17P56750 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN17P56750 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN17P56750 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN17P56750 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN17P56750 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN17P56750 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN17P56750 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN17P56750 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN17P56750 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN17P56750 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN17P56750 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN17P56750 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN17P56750 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN17P56750 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN17P56750 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN17P56750 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN17P56750 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLDN17P56750 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CLDN17P56750 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CLDN17P56750 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CLDN17P56750 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLDN17P56750 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLDN17P56750 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLDN17P56750 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLDN17P56750 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLDN17P56750 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLDN17P56750 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLDN17P56750 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLDN17P56750 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLDN17P56750 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms