Protein–RNA interactions for Protein: P54764

EPHA4, Ephrin type-A receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 986 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA4P54764 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EPHA4P54764 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms