Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNA2D1P54289 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNA2D1P54289 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNA2D1P54289 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNA2D1P54289 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNA2D1P54289 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNA2D1P54289 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNA2D1P54289 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNA2D1P54289 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNA2D1P54289 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNA2D1P54289 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA2D1P54289 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA2D1P54289 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA2D1P54289 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA2D1P54289 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA2D1P54289 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA2D1P54289 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA2D1P54289 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA2D1P54289 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA2D1P54289 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA2D1P54289 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA2D1P54289 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA2D1P54289 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA2D1P54289 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA2D1P54289 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA2D1P54289 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA2D1P54289 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA2D1P54289 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA2D1P54289 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA2D1P54289 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA2D1P54289 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA2D1P54289 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA2D1P54289 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA2D1P54289 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA2D1P54289 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA2D1P54289 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA2D1P54289 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA2D1P54289 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA2D1P54289 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA2D1P54289 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA2D1P54289 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA2D1P54289 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA2D1P54289 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA2D1P54289 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA2D1P54289 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA2D1P54289 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA2D1P54289 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA2D1P54289 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA2D1P54289 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA2D1P54289 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA2D1P54289 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA2D1P54289 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA2D1P54289 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA2D1P54289 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA2D1P54289 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA2D1P54289 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA2D1P54289 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA2D1P54289 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA2D1P54289 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA2D1P54289 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA2D1P54289 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA2D1P54289 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA2D1P54289 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA2D1P54289 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA2D1P54289 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA2D1P54289 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA2D1P54289 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA2D1P54289 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA2D1P54289 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA2D1P54289 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA2D1P54289 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA2D1P54289 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA2D1P54289 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA2D1P54289 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA2D1P54289 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA2D1P54289 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA2D1P54289 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA2D1P54289 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA2D1P54289 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA2D1P54289 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA2D1P54289 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA2D1P54289 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA2D1P54289 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA2D1P54289 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA2D1P54289 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA2D1P54289 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA2D1P54289 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA2D1P54289 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA2D1P54289 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA2D1P54289 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA2D1P54289 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA2D1P54289 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA2D1P54289 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA2D1P54289 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA2D1P54289 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA2D1P54289 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA2D1P54289 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA2D1P54289 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA2D1P54289 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNA2D1P54289 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms