Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNB3P54284 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms