Protein–RNA interactions for Protein: P53602

MVD, Diphosphomevalonate decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVDP53602 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MVDP53602 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MVDP53602 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MVDP53602 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MVDP53602 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
MVDP53602 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MVDP53602 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MVDP53602 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MVDP53602 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MVDP53602 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MVDP53602 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MVDP53602 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MVDP53602 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MVDP53602 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MVDP53602 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MVDP53602 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MVDP53602 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MVDP53602 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MVDP53602 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MVDP53602 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MVDP53602 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MVDP53602 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MVDP53602 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MVDP53602 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MVDP53602 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MVDP53602 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MVDP53602 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MVDP53602 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MVDP53602 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MVDP53602 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MVDP53602 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MVDP53602 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MVDP53602 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MVDP53602 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MVDP53602 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MVDP53602 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MVDP53602 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MVDP53602 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MVDP53602 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MVDP53602 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MVDP53602 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MVDP53602 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MVDP53602 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MVDP53602 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MVDP53602 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MVDP53602 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MVDP53602 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MVDP53602 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MVDP53602 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MVDP53602 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MVDP53602 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MVDP53602 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MVDP53602 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MVDP53602 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MVDP53602 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MVDP53602 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MVDP53602 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MVDP53602 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MVDP53602 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MVDP53602 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
MVDP53602 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MVDP53602 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MVDP53602 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MVDP53602 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MVDP53602 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MVDP53602 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
MVDP53602 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MVDP53602 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MVDP53602 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MVDP53602 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MVDP53602 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MVDP53602 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MVDP53602 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MVDP53602 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MVDP53602 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MVDP53602 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MVDP53602 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MVDP53602 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MVDP53602 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MVDP53602 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MVDP53602 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MVDP53602 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MVDP53602 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MVDP53602 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
MVDP53602 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MVDP53602 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MVDP53602 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MVDP53602 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MVDP53602 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MVDP53602 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MVDP53602 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MVDP53602 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MVDP53602 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MVDP53602 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MVDP53602 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MVDP53602 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MVDP53602 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MVDP53602 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MVDP53602 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MVDP53602 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms