Protein–RNA interactions for Protein: P52209

PGD, 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGDP52209 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PGDP52209 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PGDP52209 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PGDP52209 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PGDP52209 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PGDP52209 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PGDP52209 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PGDP52209 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PGDP52209 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PGDP52209 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PGDP52209 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PGDP52209 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PGDP52209 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PGDP52209 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PGDP52209 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PGDP52209 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PGDP52209 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PGDP52209 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PGDP52209 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PGDP52209 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PGDP52209 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PGDP52209 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PGDP52209 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PGDP52209 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PGDP52209 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PGDP52209 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PGDP52209 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PGDP52209 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PGDP52209 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PGDP52209 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PGDP52209 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PGDP52209 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PGDP52209 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PGDP52209 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PGDP52209 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PGDP52209 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PGDP52209 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PGDP52209 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PGDP52209 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PGDP52209 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PGDP52209 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PGDP52209 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PGDP52209 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PGDP52209 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PGDP52209 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PGDP52209 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PGDP52209 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PGDP52209 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PGDP52209 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PGDP52209 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PGDP52209 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PGDP52209 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PGDP52209 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PGDP52209 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PGDP52209 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PGDP52209 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PGDP52209 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PGDP52209 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PGDP52209 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PGDP52209 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PGDP52209 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PGDP52209 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PGDP52209 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PGDP52209 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PGDP52209 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PGDP52209 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PGDP52209 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PGDP52209 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PGDP52209 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PGDP52209 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PGDP52209 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PGDP52209 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PGDP52209 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PGDP52209 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PGDP52209 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PGDP52209 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PGDP52209 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PGDP52209 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PGDP52209 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PGDP52209 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PGDP52209 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PGDP52209 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PGDP52209 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PGDP52209 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PGDP52209 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PGDP52209 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PGDP52209 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PGDP52209 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PGDP52209 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PGDP52209 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PGDP52209 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PGDP52209 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PGDP52209 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PGDP52209 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PGDP52209 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PGDP52209 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PGDP52209 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PGDP52209 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PGDP52209 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PGDP52209 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms