Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DAP3P51398 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DAP3P51398 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DAP3P51398 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DAP3P51398 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DAP3P51398 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DAP3P51398 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DAP3P51398 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DAP3P51398 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DAP3P51398 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DAP3P51398 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DAP3P51398 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DAP3P51398 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DAP3P51398 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DAP3P51398 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DAP3P51398 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DAP3P51398 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DAP3P51398 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DAP3P51398 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DAP3P51398 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DAP3P51398 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DAP3P51398 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DAP3P51398 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DAP3P51398 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DAP3P51398 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DAP3P51398 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DAP3P51398 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DAP3P51398 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DAP3P51398 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DAP3P51398 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DAP3P51398 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DAP3P51398 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DAP3P51398 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DAP3P51398 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DAP3P51398 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DAP3P51398 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DAP3P51398 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DAP3P51398 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DAP3P51398 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DAP3P51398 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DAP3P51398 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DAP3P51398 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DAP3P51398 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DAP3P51398 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DAP3P51398 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DAP3P51398 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DAP3P51398 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DAP3P51398 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DAP3P51398 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DAP3P51398 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DAP3P51398 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DAP3P51398 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DAP3P51398 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DAP3P51398 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DAP3P51398 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DAP3P51398 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DAP3P51398 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DAP3P51398 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DAP3P51398 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DAP3P51398 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DAP3P51398 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DAP3P51398 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DAP3P51398 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DAP3P51398 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DAP3P51398 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DAP3P51398 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DAP3P51398 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DAP3P51398 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DAP3P51398 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DAP3P51398 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DAP3P51398 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DAP3P51398 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DAP3P51398 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DAP3P51398 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DAP3P51398 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DAP3P51398 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DAP3P51398 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
DAP3P51398 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DAP3P51398 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DAP3P51398 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
DAP3P51398 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DAP3P51398 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
DAP3P51398 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DAP3P51398 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DAP3P51398 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DAP3P51398 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DAP3P51398 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DAP3P51398 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DAP3P51398 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DAP3P51398 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DAP3P51398 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DAP3P51398 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DAP3P51398 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DAP3P51398 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DAP3P51398 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DAP3P51398 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DAP3P51398 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DAP3P51398 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DAP3P51398 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DAP3P51398 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms