Protein–RNA interactions for Protein: P51148

RAB5C, Ras-related protein Rab-5C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5CP51148 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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RAB5CP51148 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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RAB5CP51148 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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RAB5CP51148 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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RAB5CP51148 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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RAB5CP51148 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB5CP51148 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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