Protein–RNA interactions for Protein: P49368

CCT3, T-complex protein 1 subunit gamma, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT3P49368 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCT3P49368 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCT3P49368 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCT3P49368 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCT3P49368 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCT3P49368 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCT3P49368 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCT3P49368 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCT3P49368 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCT3P49368 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCT3P49368 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCT3P49368 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCT3P49368 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCT3P49368 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCT3P49368 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCT3P49368 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCT3P49368 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCT3P49368 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCT3P49368 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CCT3P49368 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCT3P49368 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCT3P49368 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCT3P49368 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCT3P49368 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCT3P49368 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCT3P49368 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCT3P49368 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCT3P49368 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCT3P49368 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCT3P49368 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCT3P49368 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCT3P49368 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCT3P49368 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCT3P49368 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCT3P49368 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCT3P49368 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCT3P49368 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCT3P49368 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCT3P49368 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCT3P49368 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCT3P49368 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCT3P49368 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCT3P49368 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCT3P49368 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCT3P49368 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCT3P49368 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCT3P49368 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCT3P49368 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCT3P49368 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCT3P49368 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCT3P49368 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCT3P49368 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCT3P49368 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCT3P49368 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCT3P49368 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCT3P49368 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CCT3P49368 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCT3P49368 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCT3P49368 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCT3P49368 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCT3P49368 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCT3P49368 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCT3P49368 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCT3P49368 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCT3P49368 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCT3P49368 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCT3P49368 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCT3P49368 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCT3P49368 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCT3P49368 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCT3P49368 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCT3P49368 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCT3P49368 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCT3P49368 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCT3P49368 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCT3P49368 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCT3P49368 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCT3P49368 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCT3P49368 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCT3P49368 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCT3P49368 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCT3P49368 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCT3P49368 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCT3P49368 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CCT3P49368 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCT3P49368 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCT3P49368 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCT3P49368 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCT3P49368 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCT3P49368 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCT3P49368 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCT3P49368 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CCT3P49368 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCT3P49368 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCT3P49368 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCT3P49368 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCT3P49368 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCT3P49368 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCT3P49368 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCT3P49368 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms